Chemia obliczeniowa w laboratorium organicznym

• Kategorie:
  1. Ebooki i Audiobooki »
  2. Nauki o zdrowiu »
  3. Chemia
• Redakcja: Anna Kaczmarek-Kędziera, Dariusz Kędziera, Marta Ziegler-Borowska
• Język wydania: polski
• ISBN: 978-83-231-3114-4
• ISBN druku: 978-83-231-3114-4
• Liczba stron: 440
• Sposób dostarczenia produktu elektronicznego
  Produkty elektroniczne takie jak Ebooki czy Audiobooki są udostępniane online po uprzednim opłaceniu (PayU, BLIK) na stronie Twoje konto > Biblioteka.

  Pliki można pobrać zazwyczaj w ciągu kilku-kilkunastu minut po uzyskaniu poprawnej autoryzacji płatności, choć w przypadku niektórych publikacji elektronicznych czas oczekiwania może być nieco dłuższy.

  Sprzedaż terytorialna towarów elektronicznych jest regulowana wyłącznie ograniczeniami terytorialnymi licencji konkretnych produktów.
• Ważne informacje techniczne
• Minimalne wymagania sprzętowe:
  • procesor: architektura x86 1GHz lub odpowiedniki w pozostałych architekturach
  • Pamięć operacyjna: 512MB
  • Monitor i karta graficzna: zgodny ze standardem XGA, minimalna rozdzielczość 1024x768 16bit
  • Dysk twardy: dowolny obsługujący system operacyjny z minimalnie 100MB wolnego miejsca
  • Mysz lub inny manipulator + klawiatura
  • Karta sieciowa/modem: umożliwiająca dostęp do sieci Internet z prędkością 512kb/s
• Minimalne wymagania oprogramowania:
  • System Operacyjny: System MS Windows 95 i wyżej, Linux z X.ORG, MacOS 9 lub wyżej, najnowsze systemy mobilne: Android, iPhone, SymbianOS, Windows Mobile
  • Przeglądarka internetowa: Internet Explorer 7 lub wyżej, Opera 9 i wyżej, FireFox 2 i wyżej, Chrome 1.0 i wyżej, Safari 5
  • Przeglądarka z obsługą ciasteczek i włączoną obsługą JavaScript
  • Zalecany plugin Flash Player w wersji 10.0 lub wyżej.
• Informacja o formatach plików:
  • PDF - format polecany do czytania na laptopach oraz komputerach stacjonarnych.
  • EPUB - format pliku, który umożliwia czytanie książek elektronicznych na urządzeniach z mniejszymi ekranami (np. e-czytnik lub smartfon), dając możliwość dopasowania tekstu do wielkości urządzenia i preferencji użytkownika.
  • MOBI - format zapisu firmy Mobipocket, który można pobrać na dowolne urządzenie elektroniczne (np.e-czytnik Kindle) z zainstalowanym programem (np. MobiPocket Reader) pozwalającym czytać pliki MOBI.
  • Audiobooki w formacie MP3 - format pliku, przeznaczony do odsłuchu nagrań audio.
• Rodzaje zabezpieczeń plików:
  • Watermark - (znak wodny) to zaszyfrowana informacja o użytkowniku, który zakupił produkt. Dzięki temu łatwo jest zidentyfikować użytkownika, który rozpowszechnił produkt w sposób niezgodny z prawem.
  • Brak zabezpieczenia - część oferowanych w naszym sklepie plików nie posiada zabezpieczeń. Zazwyczaj tego typu pliki można pobierać ograniczoną ilość razy, określaną przez dostawcę publikacji elektronicznych. W przypadku zbyt dużej ilości pobrań plików na stronie WWW pojawia się stosowny komunikat.

  Więcej informacji o publikacjach elektronicznych

Wprowadzenie / 9
Przedmowa / 11

1. Elementy chemii kwantowej / 17
1.1. Energia układu / 19
1.2. Powierzchnia energii potencjalnej / 24
1.3. Warsztat z narzędziami / 27
1.3.1. Metoda wariacyjna / 28
1.3.2. Szeregi funkcyjne / 29
1.3.3. Rachunek zaburzeń / 31
1.4. Przybliżenie jednoelektronowe / 32
1.5. Bazy funkcyjne/ 38
1.6. Metody chemii kwantowej / 43
1.6.1. Sposoby uwzględniania korelacji elektronowej / 45
1.6.2. Teoria funkcjonałów gęstości/ 47

2. Opis układów π-elektronowych / 51
2.1. Przybliżenie π-elektronowe / 51
2.2. Metoda H¨uckla / 52
2.2.1. Cząsteczka etylenu / 54
2.2.2. Annuleny / 61
2.2.3. Widmo absorpcyjne / 62
2.2.4. Rozkład ładunku π-elektronowego
Rząd wiązania π / 65

3. Struktura pojedynczej cząsteczki / 71
3.1. Wstęp / 71
3.2. Wspołrzędne kartezjańskie i wewnętrzne / 74
3.3. Gaussian09 - struktura inputu / 81
3.4. Gaussian09 - energia układu / 83
3.5. Gaussian09 - optymalizacja geometrii / 115
3.5.1. Aldehyd octowy/ 116
3.5.2. (1S)-(–)-α-Pinen/ 131
3.6. Gaussian09 - analiza drgań harmonicznych / 140
3.6.1. Aldehyd octowy / 142
3.7. Gaussian09 - stan przejściowy / 157
3.7.1. Amoniak / 158
3.7.2. Aldehyd 3-aminoakrylowy / 164
3.8. Gaussian09 - analiza powierzchni energii potencjalnej / 167
3.8.1. Glicyna / 167
3.9. Gaussian09 - skan powierzchni energii potencjalnej / 173
3.9.1. Oddziaływanie benzenu z kationem sodu / 173
3.9.2. 1,2-Dichloroetan / 177
3.10. Gaussian09 - ścieżki reakcji / 184

4. Właściwości spektroskopowe cząsteczek / 193
4.1. Gaussian09 - widmo UV / 193
4.1.1. Etylen / 195
4.1.2. Izopren / 202
4.1.3. Metyloheksahydronaftalenon / 208
4.2. Gaussian09 - widmo NMR / 211
4.2.1. 2-Buten - przesunięcie chemiczne w 1H NMR / 214
4.3. Gaussian09 - skręcalność właściwa / 223
4.3.1. Kwas (S)-(−)-parakonowy / 228

5 Cząsteczka w otoczeniu chemicznym / 237
5.1. Słabe oddziaływania międzymolekularne / 237
5.1.1. Gaussian09 - energia oddziaływania międzymolekularnego / 243
5.1.2. Gaussian09 - zautomatyzowany sposób liczenia oddziaływań / 251
5.1.3. Gaussian09 - skan oddziaływania po odległości / 254
5.2. Gaussian09 - modelowanie efektów rozpuszczalnikowych / 259
5.2.1. Optymalizacja geometrii w rozpuszczalniku / 262
5.2.2. Swobodna entalpia solwatacji / 266
5.2.3. Wpływ efektów rozpuszczalnikowych na stan równowagi chemicznej / 269
5.2.4. Wpływ efektów rozpuszczalnikowych na wysokość barier rotacji / 272
5.2.5. Widmo IR w fazie skondensowanej / 273
5.2.6. Przesunięcie solwatochromowe  / 279
5.2.7. Wpływ rozpuszczalnika na położenie sygnałów NMR / 282
5.2.8. Wpływ rozpuszczalnika na skręcalność / 283

6. Chemia obliczeniowa w pracy eksperymentalnej / 287
6.1. Lipofilowość / 287
6.1.1. Zasady kwasów nukleinowych / 289
6.2. Kwasowość/zasadowość / 292
6.2.1. Deprotonowanie pirolu / 292
6.2.2. Stała proteolizy / 300
6.2.3. Potencjał redox / 302
6.3. Reaktywność produktów pośrednich / 303
6.4. Reaktywność układów aromatycznych / 305
6.4.1. Aromatyczność układów organicznych / 305
6.4.2. Substytucja elektrofilowa w pierścieniu aromatycznym / 314
6.4.3. Substytucja elektrofilowa w układach heterocyklicznych / 317
6.5. Opis układow otwartopowłokowych / 318
6.5.1. Kation, rodnik i anion allilowy / 321
6.6. Reakcje pericykliczne / 327
6.6.1. Reakcje cykloaddycji / 328
6.6.2. Reakcje elektrocyklizacji / 339

7. Zadania i ćwiczenia / 345

A Linux: Rzecz o wolności  / 361
A.1. Logowanie / 361
A.2. Komunikacja pomiędzy maszynami / 362
A.2.1. ssh, scp / 362
A.2.2. Window(s) na świat: PuTTy, WinSCP  / 364
A.3. Podstawowe komendy / 364
A.4. Edytor tekstu / 367
A.5. Inne przydatne narzędzia / 370
B Rozwiązania zadań / 375

Bibliografia / 413
Indeks rzeczowy / 433
Ilustracje / 439