Prof. Marek Prost jest specjalistą chorób oczu, absolwentem Akademii Medycznej w Lublinie. W latach 1973-1994 pracował w Klinice Okulistyki Akademii Medycznej w Lublinie. W latach 1994-2002 był kierownikiem Kliniki Okulistyki Instytutu „Pomnik Centrum Zdrowia Dziecka”. Od 2002 r. jest kierownikiem Kliniki Okulistycznej Wojskowego Instytutu Medycyny Lotniczej w Warszawie. W latach 2002 – 2016 był Zastępcą Dyrektora ds. Naukowych Wojskowego Instytutu Medycyny Lotniczej w Warszawie. W 1995r. stworzył warz z żoną, dr n. med. Ewą Oleszczyńską-Prost, Centrum Okulistyki Dziecięcej, prywatną placówkę służby zdrowia zajmującą się kompleksową opieką i leczeniem dzieci z chorobami narządu wzroku, w której pracuje do chwili obecnej.
Prof. Marek Prost jako pierwszy w naszym kraju zaczął wszczepiać soczewki wewnątrzgałkowe u dzieci, w tym soczewki wieloogniskowe, soczewki podszywane do twardówki, podwieszane na tęczówce w komorze tylnej oraz rozpoczął wykonywać chirurgię refrakcyjną przy dużych wadach wzroku u dzieci. W 1990 r. rozpoczął jako pierwszy w Polsce wykonywać operacje witrektomii u wcześniaków i małych dzieci. Jako jeden z pierwszych w Polsce zaczął wykonywać operacje zaćmy metodą lentektomii i wszczepiać zastawki przeciw jaskrowe u dzieci i implanty oczodołowe oraz wykonywać laserowe operacje dróg łzowych.
