0 POZYCJI
KOSZYK PUSTY

Podstawy chemoinformatyki leków. Wydanie drugie rozszerzone - 02 Rozdz. 4, 5 Chemia in silico – problemy przetwarzania danych; Internetowe zasoby i nowe technologie chemoinformatyczne on-line; Literatura dodatkowa; Dodatek

(eBook)
0.00  (0 ocen)
 Dodaj recenzję
Rozwiń szczegóły
  • Druk: Katowice, 2018

  • Wydanie/Copyright: wyd. 2

  • Autor: Andrzej Bąk, Jarosław Polański

  • Wydawca: Uniwersytet Śląski

  • Formaty:
    PDF (Watermark)
    Watermark
    Znak wodny czyli Watermark to zaszyfrowana informacja o użytkowniku, który zakupił produkt. Dzięki temu łatwo jest zidentyfikować użytkownika, który rozpowszechnił produkt w sposób niezgodny z prawem. Ten rodzaj zabezpieczenia jest zdecydowanie najbardziej przyjazny dla użytkownika, ponieważ aby otworzyć książkę zabezpieczoną Watermarkiem nie jest potrzebne konto Adobe ID oraz autoryzacja urządzenia.

Zwiń szczegóły
Produkt niedostępny
Dodaj do schowka

Podstawy chemoinformatyki leków. Wydanie drugie rozszerzone - 02 Rozdz. 4, 5 Chemia in silico – problemy przetwarzania danych; Internetowe zasoby i nowe technologie chemoinformatyczne on-line; Literatura dodatkowa; Dodatek

Na polskim rynku księgarskim dostępnych jest szereg podręczników poświęconych chemii leków oraz projektowaniu leków, brakuje natomiast podręcznika poświęconego chemoinformatyce. W zamyśle autorów niniejszy skrypt ma za zadanie wypełnić tę lukę. Ponieważ od swych źródeł chemoinformatyka łączy się z projektowaniem molekularnym, wyeksponowaliśmy w szczególności problemy chemoinformatyki leków. Odpowiada to profilowi nowych specjalności, chemii leków oraz chemii informatycznej, uruchomionych w Instytucie Chemii Uniwersytetu Śląskiego. Podręcznik przeznaczony jest dla studentów chemii i farmacji, którzy interesują się wykorzystaniem komputera jako narzędzia wspomagającego badania oraz dydaktykę tych przedmiotów.

  • Kategorie:
    1. Ebooki i Audiobooki »
    2. Nauki o zdrowiu »
    3. Chemia
  • Język wydania: polski
  • ISBN: 978-83-8012-897-2
  • ISBN druku: 978-83-8012-896-5
  • Sposób dostarczenia produktu elektronicznego
    Produkty elektroniczne takie jak Ebooki czy Audiobooki są udostępniane online po uprzednim opłaceniu (PayU, BLIK) na stronie Twoje konto > Biblioteka.
    Pliki można pobrać zazwyczaj w ciągu kilku-kilkunastu minut po uzyskaniu poprawnej autoryzacji płatności, choć w przypadku niektórych publikacji elektronicznych czas oczekiwania może być nieco dłuższy.
    Sprzedaż terytorialna towarów elektronicznych jest regulowana wyłącznie ograniczeniami terytorialnymi licencji konkretnych produktów.
  • Ważne informacje techniczne
  • Minimalne wymagania sprzętowe:
    • procesor: architektura x86 1GHz lub odpowiedniki w pozostałych architekturach
    • Pamięć operacyjna: 512MB
    • Monitor i karta graficzna: zgodny ze standardem XGA, minimalna rozdzielczość 1024x768 16bit
    • Dysk twardy: dowolny obsługujący system operacyjny z minimalnie 100MB wolnego miejsca
    • Mysz lub inny manipulator + klawiatura
    • Karta sieciowa/modem: umożliwiająca dostęp do sieci Internet z prędkością 512kb/s
  • Minimalne wymagania oprogramowania:
    • System Operacyjny: System MS Windows 95 i wyżej, Linux z X.ORG, MacOS 9 lub wyżej, najnowsze systemy mobilne: Android, iPhone, SymbianOS, Windows Mobile
    • Przeglądarka internetowa: Internet Explorer 7 lub wyżej, Opera 9 i wyżej, FireFox 2 i wyżej, Chrome 1.0 i wyżej, Safari 5
    • Przeglądarka z obsługą ciasteczek i włączoną obsługą JavaScript
    • Zalecany plugin Flash Player w wersji 10.0 lub wyżej.
  • Informacja o formatach plików:
    • PDF - format polecany do czytania na laptopach oraz komputerach stacjonarnych.
    • EPUB - format pliku, który umożliwia czytanie książek elektronicznych na urządzeniach z mniejszymi ekranami (np. e-czytnik lub smartfon), dając możliwość dopasowania tekstu do wielkości urządzenia i preferencji użytkownika.
    • MOBI - format zapisu firmy Mobipocket, który można pobrać na dowolne urządzenie elektroniczne (np.e-czytnik Kindle) z zainstalowanym programem (np. MobiPocket Reader) pozwalającym czytać pliki MOBI.
    • Audiobooki w formacie MP3 - format pliku, przeznaczony do odsłuchu nagrań audio.
  • Rodzaje zabezpieczeń plików:
    • Watermark - (znak wodny) to zaszyfrowana informacja o użytkowniku, który zakupił produkt. Dzięki temu łatwo jest zidentyfikować użytkownika, który rozpowszechnił produkt w sposób niezgodny z prawem.
    • Brak zabezpieczenia - część oferowanych w naszym sklepie plików nie posiada zabezpieczeń. Zazwyczaj tego typu pliki można pobierać ograniczoną ilość razy, określaną przez dostawcę publikacji elektronicznych. W przypadku zbyt dużej ilości pobrań plików na stronie WWW pojawia się stosowny komunikat.
    Więcej informacji o publikacjach elektronicznych
Spis treści

Przedmowa do wydania drugiego / 9

1. Wstęp / 11
2. Przedmiot chemii i chemoinformatyki / 13
3. Komputer jako narzędzie pracy chemika – problemy wprowadzania danych / 21
3.1. Kodowanie cząsteczek w chemoinformatyce / 26
3.2. Grafy cząsteczek chemicznych / 26
3.3. Notacja liniowa / 28
3.3.1. Kody SMILES / 30
3.3.1.1. SMILES – język kodowania grafów molekularnych / 30
3.3.1.2. Gramatyka języka SMILES / 31
3.3.2. Inne systemy notacji liniowej / 41
3.4. Macierzowe systemy kodowania konstytucji cząsteczki / 42
3.5. Edytory molekularne / 50
3.6. Standardy wymiany informacji strukturalnej / 60
3.7. Nomenklatura chemiczna / 68
3.8. Związek chemiczny – in vitro oraz in silico / 72
3.9. Ontologia chemiczna – formalna definicja związku chemicznego / 73
3.10. Właściwości związków chemicznych i ich pomiary / 76
3.11. Chemiczne bazy danych / 78
3.11.1. Organizacja bazy danych / 78
3.11.2. Typy baz danych / 80
3.11.3. Strukturalne bazy danych ligandów / 83
3.11.4. Strukturalne bazy danych makromolekuł / 86
3.11.5. Bazy literaturowe / 90

4. Chemia in silico – problemy przetwarzania danych / 93
4.1. Deskryptory molekularne / 93
4.1.1. Kodujące deskryptory konstytucyjne / 95
4.1.2. Deskryptory daktyloskopowe cząsteczki / 95
4.1.3. Deskryptory obliczane na podstawie atomowej reprezentacji cząsteczki / 95
4.1.4. Deskryptory obliczane na podstawie fragmentów molekularnych / 96
4.1.5. Deskryptory topologiczne / 96
4.1.6. Proste deskryptory geometryczne / 97
4.1.7. Złożone deskryptory geometryczne / 97
4.1.7.1. Deskryptory pola oddziaływań cząsteczkowych / 97
4.1.7.2. Deskryptory profilu konformacyjnego / 98
4.1.7.3. Deskryptory wirtualnego miejsca receptorowego / 98
4.1.7.4. Deskryptory receptorowe / 100
4.1.8. Deskryptory złożonych systemów cząsteczkowych ligand – receptor / 100
4.1.9. Deskryptory skorelowane z właściwościami / 100
4.1.9.1. Korelaty właściwości globalnych / 100
4.1.9.2. Korelaty fragmentów molekularnych – stałe Hammetta / 101
4.1.9.3. Prognozowanie właściwości związków chemicznych / 104
4.2. Modelowanie struktur 3D / 107
4.2.1. Generatory struktur 2D / 110
4.2.2. Generatory struktur 3D / 110
4.2.2.1. Semiempiryczne metody chemii kwantowej / 116
4.2.2.2. Mechanika molekularna / 117
4.2.2.3. Dynamika molekularna / 125
4.2.2.4. Techniki generowania konformerów / 133
4.2.3. Pakiety do modelowania molekularnego / 134
4.3. Podobieństwo strukturalne cząsteczek / 139
4.4. Synteza i retrosynteza / 152
4.4.1. Synteza organiczna – odwzorowanie reagentów w produkty / 154
4.4.2. Projektowanie syntezy organicznej – odwzorowanie produktów w reagenty / 155
4.4.3. Retroreakcje – nomenklatura syntonów / 160
4.4.4. Operacje na syntonach / 160
4.4.4.1. Przekształcenie syntonu w reagent / 160
4.4.4.2. Modyfikacje syntonów / 162
4.4.4.3. Odwrócenie reaktywności / 163
4.4.5. Komputerowo wspomagane projektowanie syntezy (CASD) / 164
4.5. Eksploracja baz danych / 166
4.6. Chemometria – analizy złożonych danych chemicznych / 169
4.6.1. Wybrane metody analizy struktury danych / 170
4.6.2. Podstawowe pojęcia chemometrii / 171
4.6.3. Zmienne i ich korelacje / 171
4.6.4. Wstępna transformacja danych / 173
4.6.5. Eksploracja danych / 175
4.6.6. Jednoczynnikowa analiza wariancji / 175
4.6.7. Wieloczynnikowa analiza wariancji / 178
4.6.8. Algorytmy genetyczne / 180
4.6.9. Wybrane techniki projekcji i wizualizacji wielu zmiennych / 183
4.6.10. Analiza czynników głównych / 183
4.6.11. Sieci neuronowe / 185
4.6.12. Analiza regresji / 198
4.6.13. Metoda najmniejszych kwadratów / 201
4.6.14. Analiza regresji czynników głównych / 205
4.6.15. Metoda częściowych najmniejszych kwadratów / 205
4.6.16. Walidacja krzyżowa / 207
4.7. Komputerowe wspomaganie projektowania molekularnego / 212
4.8. Synteza ukierunkowana na właściwości / 214
4.8.1. Intuicja i szczęśliwy traf w poszukiwaniach i odkryciach nowych leków / 215
4.8.2. Schematy racjonalne w poszukiwaniu nowych leków – badanie zależności między budową a działaniem związków / 215
4.8.3. Badania przesiewowe metodami chemii kombinatorycznej / 223
4.8.4. Projektowanie molekularne in silico / 224
4.8.5. Projektowanie leków, kiedy dostępne są dane strukturalne receptora / 224
4.8.6. Dokowanie molekularne / 227
4.8.7. Projektowanie oparte na szeregu aktywnych ligandów / 233
4.8.8. Ilościowe modele zależności struktura – aktywność QSAR / 235
4.8.8.1. Modele 0D QSAR / 236
4.8.8.2. Modele 1D QSAR / 237
4.8.8.3. Modele 2D QSAR / 237
4.8.8.4. Modele 3D QSAR / 239
4.8.8.5. Modele 4D QSAR / 243
4.8.8.6. Modele 5D QSAR / 244
4.8.8.7. Modele 6D QSAR / 245
4.8.8.8. Modele RI-QSAR z wirtualnym receptorem modelowanym danymi innymi niż szereg jego aktywnych ligandów / 245
4.8.8.9. Modele RD QSAR z rzeczywistymi danymi receptorowymi / 246
4.8.9. Lekotypy / 247

5. Internetowe zasoby i nowe technologie chemoinformatyczne on-line / 249

Literatura dodatkowa / 255
Dodatek / 257

Inni Klienci oglądali również

24,30 zł 27,00 zł
Do koszyka

Podstawy geodezyjnego wyznaczania przemieszczeń. Pojęcia i elementy metodyki

Niniejszy podręcznik poświęcony jest warstwie pojęciowej i terminologicznej wyznaczania przemieszczeń budowli inżynierskich i ich otoczenia na podstawie pomiarów geodezyjnych. Omówione są pojęcia odnoszące się do podstawowych metod opraco...
143,10 zł 159,00 zł
Do koszyka

Pozwolenie wodnoprawne jako instrument zarządzania zasobami wodnymi

Prezentowana publikacja to kompleksowe opracowanie dotyczące pozwolenia wodnoprawnego jako instrumentu zarządzania zasobami wodnymi - porusza zatem kwestie, które dotychczas nie doczekały się opracowania w piśmiennictwie albo były przedstawiane ...
13,41 zł 14,90 zł
Do koszyka

Jak w praktyce stosować nowe przepisy prawa pracy obowiązujące w 2018 r.

Publikacja przedstawia opis najważniejszych zmian jakie wejdą w życie w zakresie prawa pracy i ubezpieczeń społecznych w 2018 r. Można się z niej dowiedzieć jak przygotować się do tych zmian, co powinni zrobić pracodawcy, i o czym muszą pamiętać w 2018...
9,90 zł 11,00 zł
Do koszyka

Nowe fikołki pana Pierdziołki

Pan Pierdziołka, ten od stołka, swoją pierwszą książką podbił serca tysięcy czytelników. W kolejnym tomie powtarzanek i śpiewanek dowiemy się o nowych fikołkach naszego ulubieńca, o tym że wyprowadził się z Grajdołka, …...
18,90 zł 21,00 zł
Do koszyka

Fantastyka w literaturach słowiańskich

Tom poświęcony jest najpopularniejszym gatunkom i zjawiskom występującym w obrębie fantastyki słowiańskiej, przede wszystkim polskiej i rosyjskiej. Czytelnik znajdzie w nim artykuły dotyczące rozmaitych aspektów omawianego fenomenu. Autorzy teks...
22,50 zł 25,00 zł
Do koszyka

Sacrum w literaturze dziecięcej i młodzieżowej

Studia naukowe pomieszczone w monografii oscylują między wąskim (związanym z bezpośrednim przejawianiem się świętości, praktykowaniem religii) i szerokim (odwołującym się do pośrednich znaczeń, różnych sfer duchowości) rozumieniem sacrum. Jego l...

Recenzje

Dodaj recenzję
Nikt nie dodał jeszcze recenzji. Bądź pierwszy!